1. m7G修饰简介
m7G修饰是RNA转录后修饰之一,存在于许多不同类型的RNA中。通过对RNA中m7G修饰的准确鉴定,揭示了m7G在基因表达调控和不同生理功能中的作用。不同类型的RNA的内部m7G修饰具有不同的功能。其中,tRNA m7G修饰是研究最深入的一个。
m7G修饰对tRNA表达、结构稳定和功能具有重要作用。(以小鼠胚胎干细胞(mESCs)为例)
1)稳定核心
m7G修饰给tRNA带来正电荷,促进G46、G22和C13之间的相互作用,从而稳定tRNA的tRNA三维核心。
2)翻译效率
tRNA m7G修饰提高了m7GtRNA解码密码子(m7G密码子)依赖的方式中mRNA的翻译效率。
3)核糖体调节
tRNA m7G修饰调节核糖体易位,而m7G tRNA的缺失导致核糖体在带电tRNA结合位点(A位点)的m7G密码子上暂停。
mRNA和pri-miRNA的m7G修饰表现出与tRNA不同的功能。
1)刺激翻译:m7G甲基化稳定mRNA并刺激其翻译,作为蛋白质表达调控的一个标志;
2)增强翻译:VEGFA转录本的m7G甲基化直接增强了mRNA的翻译;
3)调节机制:然而,mRNA的m7G甲基化是否通过与m6A相同的机制调节mRNA的代谢和翻译仍有待确定。
2.m7G修饰相关蛋白
目前,对m7G修饰的调节因子的了解仍处于初步阶段。
哺乳动物中m7G 甲基转移酶主要是METTL1/WDR4、WBSCR22/TRMT112以及RNMT/RAM。
1)METTL1/WDR4:METTL1与WDR4结合介导tRNA、miRNA和mRNA发生m7G修饰。
m7G甲基化修饰是tRNA主要修饰方式之一,m7G修饰位于tRNA子集的46位,该子集在其可变环中含有RAGGU模体。
同时,这种METTL1/WDR4复合物对于正常的mRNA翻译、神经自我更新和谱系分化也是必不可少的。
METTL1作为m7G甲基转移酶在靶mRNA中发生m7G修饰,而WDR4则促进异二聚体复合物与靶mRNA的结合。这种由METTL1/WDR4介导的m7G mRNA 修饰与翻译效率高低有关。
2)WBSCR22/TRMT112:它介导真核细胞18 S rRNA 处的m7G 修饰。
WBSCR22和它的代谢稳定剂TRMT112一起参与了18S rRNA前体加工,而且与40S rRNA的前体亚单位催化活性无关,其只需提供有效的核输出即可促进核糖体的生物发生。
沉默WBSCR22会促进细胞核中18S rRNA前体的积累,最终延缓18S rRNA的成熟。这些证据表明m7G调节因子是核糖体生物发生过程中的一种质量控制机制。
3)RNMT/RAM:真核细胞转录早期过程中,RNMT/RAM甲基转移酶复合物会催化发生m7G cap修饰。
4)RNMT/RAM:RAM负责稳定RNMT结构并招募靶RNA,然后发生m7G修饰产生5’m7GpppX,它不仅保护RNA免受核酸外切酶切割,而且还影响RNA加工、输出和翻译。
5)EIF4E:EIF4E特异性地直接结合到该m7G-cap,影响靶RNA的输出和翻译效率。
6)过表达:过表达RNMT/RAM通过增加其mRNA的m7G-cap促进CCND1的翻译,从而促进乳腺上皮细胞和成纤维细胞的转化。
3.m7G在疾病中的功能
m7G修饰参与调控多种疾病,包括异常干细胞生长和分化、Galloway Mowat综合征、侏儒症等。
1)m7G甲基化与肿瘤
m7G甲基转移酶通常在癌症中异常表达,并催化tRNA或miRNA中的m7G修饰,最终影响靶基因表达并调节肿瘤相关的生物学功能。
①调控细胞周期
METTL1/WDR4复合物通过介导tRNA m7G修饰,调控细胞周期蛋白CCND3和CCNE1发挥致癌作用。
②影响癌症进展
METTL1和WDR4在肝癌组织中表达显著升高,抑制METTL1/WDR4会降低tRNA m7G修饰延缓肝癌进展。
③癌细胞增殖转移
METTL1/WDR4介导tRNA m7G修饰调节CCNA2、EGFR和VEGFA mRNA的翻译,促进肝癌细胞增殖和迁移。
2)m7G甲基化与神经退行性疾病
METTL1/WDR4突变与唐氏综合征(DS)相关。AD模型小鼠皮质和海马的兴奋性神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞中METTL1转录本的表达受到抑制。
有证据表明m7G修饰与阿尔兹海默症(AD)神经炎症有关。CD47是免疫球蛋白超家族的一种受体,与exportin-1相互作用,调节细胞外囊泡中m7G修饰的miRNA和mRNA(如let-7)。Let-7家族触发细胞内信号,导致中枢神经系统(CNS)的神经炎症和神经退行性变。